当今，关于地球上生命存在的形式有两个主流假说：“三域学说”（细菌、古菌、真核生物）和“二域学说”（细菌、古菌—真核生物）。近年来的发现证明，真核生物可能起源于古菌中的“阿斯加德古菌”，这一发现支持了“二域说”。然而，真核生物究竟起源于阿斯加德古菌的哪一支类群一直存在争议。

北京时间7日深夜，华东师范大学河口海岸全国重点实验室董宏坡研究员和侯立军研究员团队联合深圳大学研究团队在《自然》期刊上发表了最新研究成果，将真核生物起源位置精确定位为海姆达尔纲的姐妹类群。这一发现表明真核细胞的起源时间可能约在27.2亿年前，早于地球大氧气事件，为理解真核细胞形成机制提供了重要线索。

研究团队以我国红树林湿地和河口盐沼湿地为天然实验室，历时六年采集沉积物样本，利用计算生物学研究技术，揭示真核生物祖先可能在海姆达尔纲古菌分化之前就已经形成。

近年来，多项系统发育分析和基因组功能蛋白研究表明，真核生物核基因组可能从阿斯加德古菌进化而来。随着阿斯加德古菌多样性的增加，定位真核生物祖先在阿斯加德古菌门内部的分化节点变得尤为重要。2023年，《自然》发表了瑞典科学家的研究成果，将真核生物在系统发育树上定位到阿斯加德古菌的海姆达尔纲内部，与霍德尔目互为姐妹群系，但该结果因仅使用未受广泛认可的非核糖体标志蛋白基因集而备受争议。

为此，华东师范大学团队整合新组装的223个高质量的阿斯加德古菌基因组和NCBI数据库现存的基因组，构建了一个包含411个阿斯加德古菌基因组的数据集。针对最新的数据集，研究团队重新选取多套标志蛋白，结合系统基因组学方法，以高置信度将真核生物定位到阿斯加德古菌海姆达尔纲之外，与海姆达尔纲互为姐妹。

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