《暗河传》是《少年歌行》外传,故事围绕苏暮雨、苏昌河以及药王谷白鹤淮与江湖最神秘的杀手组织“暗河”展开。
暗河是江湖上的第一杀手组织,由苏、谢、慕三姓家族组成,大家长慕名策号称暗河百年来最强之人。他在刺杀唐门唐二老爷时身中奇毒雪落一枝梅,暗河顿时暗流涌动,三家家主都意在大家长之位,派出杀手去杀慕名策,夺回象征大家长之位的眠龙剑。苏暮雨是大家长直属杀手团十二蛛影的首领“傀”,负责保护大家长,与各路杀手交手。同时,大家长为解奇毒去钱塘城寻找神医白鹤淮,苏暮雨也在与白鹤淮的相处中感情升温。最终,三家在争斗中死了不少高手,家主们也都死去,苏昌河成为了暗河大家长。
苏昌河成为大家长后,暗河的真相逐渐浮出水面。原来暗河是由易水寒让手下三名顶尖刺客建立的,受影宗控制,暗河的提魂殿掌管着赏善罚恶、分配任务和财富等事务,大家长的任命也需要他们认可。但随着暗河的发展,高手越来越多,逐渐脱离了影宗的控制。此时影宗宗主易卜想要重振影宗,便企图动用暗河除掉琅琊王萧若风。苏昌河和苏暮雨不想让暗河再当影宗的影子,于是与影宗展开了一场斗智斗勇之战,最终苏昌河杀了易卜,苏暮雨焚烧了藏有卷宗的万卷楼,但暗河想要走到光明面上并不容易,他们仍然为此而战。
在《少年歌行》的故事中,苏昌河为了让暗河走向光明,带领暗河参与北离皇位之争,此时的苏昌河不择手段,将暗河带偏了,苏暮雨也与他走向了决裂,最终由苏暮雨为他送葬。而《暗河传》结束之时,距离苏暮雨一剑刺入苏昌河的胸膛,还有八年。