《乌云之上》的结局是正义得以伸张，但充满了悲剧色彩。

钟伟在调查野力健身会所案子时，查到了陈彬、周雪曼以及内鬼赵文斌。他为保护韩青，未将消息告知对方，在拍到周雪曼犯罪证据和赵文斌画面后，被王学华袭击杀害。钟伟在昏迷途中吞下一颗螺丝钉，成为破案的关键证据。

赵文斌因女儿菲菲病情恶化辞职下海，为给女儿治病和还周雪曼的钱，被周雪曼威胁利用，沦为内鬼。在女儿手术成功后，他因羞愧在和徒弟们常去的小山坡自尽。

警方根据钟伟体内的螺丝钉锁定王学华。王学华本想听从周雪曼的话逃走，但因韩青来得太快，为保护周雪曼不暴露，选择自杀。

韩青发现关键证据，周雪曼和陈彬被捕，受到法律审判，均被判死刑。

韩青成功找到了钟伟，证明了他的清白，也将犯罪集团一网打尽，但她也承受了巨大的痛苦，姐姐背叛、师父背刺、爱人牺牲，她的生活陷入了一团糟糕。

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