1996年，王祖贤与齐秦旧情复燃，其间传出他们在西藏私定终身、甚至在美国登记结婚又离婚的消息。1999年两人公开准备结婚的消息，但婚礼前夕，一女子跳出来称和齐秦曾同居多年，还有了一个已7岁的儿子，如果齐秦和王祖贤结婚，她就上法院起诉齐秦重婚，经过DNA检测，该小男孩被证明是齐秦的亲生骨肉，2002年王祖贤远赴加拿大，二人长达15年的情感纠葛画上句号。
1987年，当时黎明初入娱乐圈，是无名小卒。一心向歌坛发展的黎明便拜戴思聪为师。而王祖贤的妈妈是戴家的常客，在戴师母的介绍下，王妈妈与黎明碰面的机会日渐增加，因而对黎明很有好感，后来王妈妈索性收了黎明为干儿子。此后王妈妈除了在人前人后对干儿子赞不绝口外，更是在心中把他当作了女婿的最佳人选，创造机会让王祖贤与黎明接触。再加二人共同的朋友林俊贤在中间的撮合，王祖贤与黎明很快拍拖。
期间人们常常能看见王祖贤到黎明驻唱的尖沙咀“火凤凰”餐厅酒吧捧场。后来因黎明签约了宝丽金，王祖贤事业亦开始顺利发展，名气大增，二人见面少了，感情也由浓转淡。
在92年因拍摄《城市猎人》也一度与成龙传出诽闻。或许王祖贤最大的悲就是在感情上太过于认真，特别是与成龙，明知道对方就是抱着玩的心态，还一往情深。
王祖贤近照1月31日，王祖贤在个人社交账号晒出一张近照，并发文表示：“有的时候在想我何德何能让你们这样子爱我~所以我从来不后悔进这个圈~因为跟你们的完美相遇~阿弥陀佛”。
